Cơ quan CSĐT Công an huyện Ứng Hoà cũng đã khởi tố vụ án, khởi tố bị can và ra lệnh tạm giam với thời hạn 4 tháng đối với Phạm Thị Hiền và Lê Thanh Uyển, đã được Viện Kiểm sát nhân dân huyện Ứng Hoà phê chuẩn.

Qua điều tra ban đầu cho thấy, Quỹ tín dụng nhân dân Phương Tú, Ứng Hoà do ông Hoàng Văn Dâng - Chủ  tịch Hội đồng quản trị, bà Phạm Thị Hiền - Giám đốc, các ông Nguyễn Trung Hậu - Phó Giám đốc kiêm cán bộ tín dụng; Lê Khắc Tùng - Kế toán; Lê Thanh Uyển - Thủ quỹ tiền mặt; Nguyễn Thế Hiệp - Kiểm sát viên thường trực đã để thiếu 207/479 bộ hồ sơ vay vốn của khách hàng với số tiền là 13.254 triệu đồng/21.262 triệu đồng.

Trong 207 hồ sơ thiếu trên trên, Phó Giám đốc Nguyễn Trung Hậu khẳng định có 186 bộ hồ sơ vay vốn ông không được thẩm định. Phát hiện 124 người có tên trong sao kê vay vốn số hồ sơ mất, có 120 người không vay, nhưng quỹ tín dụng nhân dân đã xuất tiền khỏi quỹ từ tháng 4/2007 đến tháng 8/2009 là 8,030 tỷ đồng. Kiểm tra chứng từ chi và giấy nhận nợ, phát hiện có 35 chứng từ bà Phạm Thị Hiền viết với số tiền là 2,2 tỷ đồng, số còn lại bị mất.

Kiểm tra tiền mặt tồn quỹ trong sổ kế toán, sổ quỹ tính đến cuối ngày 14/9/2009 là 1.196.258.000 đồng. Ngày 21/9/2009, Ngân hàng Nhà nước Thành phố Hà Nội cùng Quỹ tín dụng nhân dân Phương Tú kiểm tra quỹ thực tế thì thấy chỉ còn 19.431.000 đồng, chênh lệch thiếu 1.176.826.600 đồng.

Thủ quỹ Lê  Thanh Uyển khai: Ngày 15/9/2009, dưới sự  chỉ đạo của Giám đốc Phạm Thị Hiền, Uyển đã mở quỹ lấy 690 triệu đồng rồi về, đã đưa cho chồng bà Hiền 340 triệu đồng, số còn lại Uyển mang về đưa cho vợ 280 triệu đồng, còn 70 triệu đồng Uyển mang theo trốn vào miền Nam chi tiêu cá nhân. Ngày 20/9/2009, Uyển đã đến cơ quan CSĐT Công an huyện Ứng Hoà tự thú và nộp về quỹ 531 triệu đồng, trong đó có 240 triệu đồng Uyển đòi lại vợ chồng bà Hiền.

Cơ  quan CSĐT Công an huyện Ứng Hoà, Ngân hàng Nhà nước Thành phố đã tiến hành kiểm tra, rà soát và tiến hành các biện pháp ổn định tình hình, bảo đảm hoạt động của quỹ tín dụng trên.